FORTEPIJONO metodinėje grupėje (pirmininkė Virginija Ruzgienė) dirba mokytojos ekspertės: Jūratė Liutkienė, Virginija Ruzgienė, Biruta Vaišienė; mokytoja metodininkė Živilė Čapienė, mokytoja Gaivilė Simaitytė. Metodinės grupės veikla yra labai aktyvi. Suorganizuota ir pravesta 12 Respublikinių jaunųjų pianistų konkursų, skirtų įžymių kompozitorių sukaktims paminėti. Taip pat – 20 Respublikinių ir Nacionalinių Balio Dvariono jaunųjų pianistų konkursų zoninių etapų Klaipėdos regione bei 25 Žemaitijos muzikos ir meno mokyklų bei Stasio Šimkaus konservatorijos fortepijono mokytojų konferencijos, seminarai-praktikumai. Mokytojai ir mokiniai kasmet dalyvauja Lietuvos fortepijono pedagogų asociacijos (LFPA) konferencijose, aukšto meistriškumo atvirose pamokose bei pedagogų koncertuose. Mokiniai yra daugelio tarptautinių ir respublikinių konkursų laureatai, aktyviai dalyvauja konservatorijos koncertinėje ir projektinėje veikloje, o baigę konservatoriją studijas tęsia Lietuvos ir užsienio aukštosiose mokyklose. 


STYGINIŲ INSTRUMENTŲ metodinėje grupėje (pirmininkė Auksė Kaziukaitienė) mokinius groti smuiku, altu, gitara moko mokytojai: mokytoja ekspertė Kristina Kupšienė; mokytoja metodininkė Skaistė Čilinskaitė, mokytojai – Angelė Čiuberkienė, Auksė Kaziukaitienė, Konrad Levicki, Dainius Žilinskas. Skyriaus mokiniai ir mokytojai – tarptautinių (A. Dombrovskio stygininkų konkurso Rygoje, A. Glazunovo smuikininkų konkurso Paryžiuje, Tarptautinio A. Dvoržako kamerinių ansamblių konkurso, konkurso „XX amžiaus muzika“) ir Nacionalinių Balio Dvariono konkursų bei Respublikinių Raimondo Katiliaus jaunųjų atlikėjų konkursų laureatai ir diplomantai. Skyrius rengia kasmetinius Žemaitijos regiono stygininkų seminarus-praktikumus, organizuoja Romualdo Žaldoko stygininkų konkursus, Nacionalinių Balio Dvariono pianistų ir stygininkų konkursų zoninius etapus, Tarptautinio jaunųjų menininkų seminaro „Gintarinė svetainė“ koncertus. Skyriaus iniciatyva 1998 m. vykusios konferencijos metu buvo įkurta Klaipėdos apskrities mokytojų-stygininkų asociacija.


PUČIAMŲJŲ INSTRUMENTŲ metodinėje grupėje (pirmininkas Egidijus Miknius) mokiniai mokosi fleitos, klarneto, obojaus, saksofono, trimito, trombono ir mušamųjų instrumentų klasėse. Šis skyrius, kaip ir Stasio Šimkaus laikais, yra vienas gausiausių, jame dirba mokytojai metodininkai – Večeslav Krasnopiorov, Antanas Milerius, Zenonas Šimkus, Rolandas Vizgaudis; vyr. mokytojas Rimantas Giedraitis; mokytojai Laura Kasinskaitė, Egidijus Miknius. Respublikiniuose konkursuose jų auklėtiniai nuolat užima prizines vietas. Aukšti įvertinimai ir tarptautiniuose konkursuose: E. Medinio jaunųjų muzikų Rujenoje (Latvija), J. Taločkos perkusininkų Ukmergėje, K. Izarto ,,Jaunasis virtuozas“ Rygoje. Daugelis absolventų sėkmingai studijuoja aukštosiose mokyklose Lietuvoje bei užsienyje. Tęsdami senąsias tradicijas, mokiniai išradingi naujomis idėjomis, kūrybiniais sumanymais, aktyvūs koncertinėje veikloje.

Metodinės grupės mokytojai kas antri metai organizuoja ir praveda Respublikinio Juozo Pakalnio jaunųjų atlikėjų pučiamaisiais ir mušamaisiais instrumentais konkurso Klaipėdos regiono atrankos turus, rengia seminarus-praktikumus, veda atviras meistriškumo pamokas Žemaitijos krašto muzikos ir meno mokyklų mokytojams ir mokiniams. Mokytojai glaudžiai bendradarbiauja su miesto kolektyvais: Klaipėdos valstybinio muzikinio teatro ir Lietuvos karinių jūrų pajėgų orkestrais, Brass kvintetu – ir rengia koncertines programas.


LIAUDIES INSTRUMENTŲ IR AKORDEONO metodinėje grupėje (pirmininkė Marina Logutenkova) šiuo metu sukauptas žinias ir patirtį savo mokiniams perduoda mokytojas ekspertas Anatolijus Tumanovas, mokytojos metodininkės Angelė Alšauskienė, Marina Logutenkova, vyresnioji mokytoja Ingrida Kurienė.

Mokytojai ne tik skaito metodinius pranešimus miesto ir respublikos pedagogų konferencijose, bet ir patys koncertuoja. Dalyvauja įvairuose projektuose, rengia kvalifikacijos tobulinimo programas, seminarus- praktikumus, meistriškumo pamokas respublikos ir Žemaitijos regiono muzikos bei meno mokyklų mokytojams bei jas įgyvendina. Pedagogai yra nuolatiniai miesto, respublikinių ir tarptautinių konkursų komisijų nariai.

Metodinės grupės mokiniai aktyviai dalyvauja koncertinėje veikloje, festivaliuose, tarptautiniuose (Italija, Lenkija, Čekija) ir respublikiniuose konkursuose, kur laimi prizines vietas. Dauguma jų toliau sėkmingai studijuoja pasirinktą instrumentą šalies ar užsienio aukštosiose mokyklose.


DAINAVIMO metodinėje grupėje (pirmininkė Rima Ramonienė) specialybės paslapčių mokinius moko mokytojos ekspertės Rūta Kociūtė-Agafonovienė, Rima Ramonienė, Giedrė Zeicaitė.



CHORO DIRIGAVIMO metodinėje grupėje (pirmininkė Jolanta Vyšniauskienė) mokinius diriguoti moko mokytoja ekspertė Jolanta Vyšniauskienė, vyresnysis mokytojas Marius Lingvenis, teatro pradžiamokslio paslaptis mokiniai gvildena su mokytoja metodininke Regina Baroniene.
Dainavimo ir choro dirigavimo mokiniai kasmet dalyvauja tarptautiniuose ir respublikiniuose konkursuose, kuriuose būna pripažinti laureatais ir diplomantais. Konservatorijos choras dažnai kviečiamas dainuoti ne tik mokyklos, bet ir miesto šventėse. Už pasiekimus mokiniai ir mokytojai ne kartą buvo apdovanoti švietimo ministro, miesto mero padėkos raštais. Mokytoja R. Ramonienė su savo mokinėmis Monika Junkaryte ir Gabija Žvinklyte dalyvavo tarptautinių konkursų laureatų apdovanojimo ceremonijose Lietuvos Respublikos Prezidentūroje.


DŽIAZO IR POPULIARIOSIOS MUZIKOS metodinė grupė (pirmininkė Livija Trakumienė) - jauniausia konservatorijoje. Ji susikūrė 2010 metais. Nuo to laiko konservatoriją baigė nemažas būrys dainininkų, kurių daugelis toliau pasirinko muzikines studijas. Metodinė grupė kasmet auga. Nuo 2019-2020 mokslo metų be popmuzikos bei džiazinio dainavimo joje atsirado džiazinio fortepijono bei džiazo ir klasikinės gitaros specialybės. Grupėje dirba ir savo meistriškumo paslaptimis su mokiniais dalijasi pop ir džiazinio vokalo pedagogės Livija Trakumienė ir Edita Bodrovaitė-Rukienė, mokytoja metodininkė, Aušra Smičiūtė-Butkevičienė, džiazo pianistas Marijus Sūdžius, saksofonininkas Laimonas Urbikas, mušamųjų instrumentų mokytojas metodininkas Večeslav Krasnopiorov ir mokytojas Mykolas Eiva bei gitaristas Eugenijus Jonavičius. Šios metodinės grupės mokytojų mokiniai sėkmingai debiutavo pirmajame festivalyje „Jaunimo džiazo maratonas – 2011", ne kartą pasirodė Pilies džiazo festivaliuose, skina prizus tarptautiniuose konkursuose, dalyvauja koncertuose bei projektuose.


MUZIKOS TEORIJOS metodinėje grupėje (metodinės grupės pirmininkė Olga Lebedeva), dirba mokytoja ekspertė Laima Sugintienė; mokytojos metodininkės – Rita Juškienė, Dalia Navikienė; vyr. mokytoja Loreta Narvilaitė; mokytojai – Olga Lebedeva, Živilė Viliutė bei Haroldas Šlikas.

Be tiesioginio pedagoginio darbo jie yra nepakeičiami koncertų, įvairioms progoms skirtų renginių vedėjai. Mokytojai jau antrą dešimtmetį rengia seminarus Žemaitijos vaikų muzikos ir meno mokyklų mokytojams bei olimpiadas jų mokiniams. Dalis jų vėliau pasirenka mokytis konservatorijoje. Dar viena skyriaus tradicija yra koncertinės-edukacinės išvykos su mokiniais. Lankytasi LNOBT, Kauno muzikiniame teatre, M. K. Čiurlionio muziejuje, mokyklos įkūrėjo Stasio Šimkaus gimtinėje Seredžiuje. Didžiulį pasisekimą turėjo grupės mokytojų organizuota viktorina „Šimkiečių ringas“ ir kt. Mokytoja L. Sugintienė jau keleri metai organizuoja „Muzikologinių pašnekesių“ ciklą, kuriame mokiniai kalba apie žanrus, juos iliustruoja, gilinasi į atskirų specialybių istoriją bei specifiką, mokosi liaudies dainų. Ciklas jau peržengė konservatorijos sienas, savo atradimais mokiniai dalijosi J. Karoso ir J. Kačinsko muzikos mokyklose. Tradicija tampa jau dešimtmetį organizuojamos mokinių išvykos į Pašto bokštą susipažinti su Klaipėdos karilionu. Taip pat rengiami susitikimai su žymiais Lietuvos atlikėjais. Skyriaus mokytojų parengti mokiniai nuolat tampa Respublikinių solfedžio konkursų laureatais.


BENDROJO FORTEPIJONO (metodinės grupės pirmininkė Živilė Čapienė) mokytojai visus konservatorijos mokinius moko skambinti fortepijonu arba, garbiojo muziko Igno Prielgausko žodžiais tariant, siekia, kad būsimasis muzikas „jaunais pirštukais bėgiotų po visą klaviatūrą“. Gausiame šio skyriaus mokytojų būryje dirba mokytojos ekspertės – Jūratė Liutkienė, Virginija Ruzgienė; mokytoja metodininkė Živilė Čapienė; vyr. mokytojos – Violeta Bastakienė, Ilona Benetienė, Aušra Vaitkutė; mokytojos – Lauryna Lankutytė, Gaivilė Simaitytė,Ieva Šličiuvienė.

Gražia skyriaus tradicija tapo kasmetinis Kalėdinis bendrojo fortepijono ir sceninės raiškos mokinių koncertas bei ketvirtokų atsisveikinimo koncertas konservatorijos salėje. Skyriaus veikla „išėjo“ už mokyklos ribų: kelinti metai organizuojama konservatorijos ir miesto muzikos ugdymo mokyklų bendrojo fortepijono mokytojų metodinė diena bei Respublikinis konkursas „Jūros eskizai“. Jau ne vienus metus vyksta Stasio Šimkaus konservatorijos ir Klaipėdos miesto mokyklų su muzikiniu ugdymu bendrojo fortepijono mokinių koncertai bei tarpmokyklinis projektas „Pažinimo raktai“.

Skyriaus mokiniai sėkmingai dalyvauja respublikiniuose bendrojo fortepijono konkursuose, kur laimi prizines vietas.


BENDROJO UGDYMO (metodinės grupės pirmininkė Gražina Olcvikienė) metodinė grupė kasmet pasipildo naujais specialistais. Šiuo metu dirbantys mokytojai: mokytoja ekspertė Roma Stonkuvienė; mokytojai metodininkai – Jūratė Čechavičienė, Albina Čukalina, Lilija Grigaitytė, Elena Jasienė, Rasa Oberhaus, Audrius Stonkus, Žydra Šmitienė, Rita Timirgalinienė, Daiva Tomanienė; vyr. mokytojai – Asta Anduleit, Gražina Olcvikienė, Tomas Stropus; mokytojai – Sigita Česnauskienė, Gitana Motiejaitė, Laura Ramonienė, Alvydas Šimkūnas, Artūras Šniaukas

Metodinės grupės mokytojai, turintys ne tik ilgametės patirties, bet ir aukštą pedagoginę kvalifikaciją, ruošia mokinius brandos egzaminams. Kasmet dalyvaujama respublikiniuose renginiuose: Konstitucijos, Europos egzaminuose, Antikos žinių olimpiadoje, Jaunųjų vertėjų, skaitovų konkursuose, įvairių dalykų „Kengūros“ konkursuose, konferencijose. Rengiama Europos kalbų diena, stalo teniso, krepšinio varžybos. Nuo 2019 metų pradžios veikia skaitytojų klubas „Ir mes skaitome knygas”, vadovaujamas mokytojos Ž. Šmitienės. Jau beveik 15 metų konservatorijos mokiniai ir mokytojai dalyvauja tarptautiniuose kalbiniuose-kultūriniuose mainų projektuose (su Ispanijos, Vokietijos, Italijos mokyklomis). Projektinė veikla vienija bendruomenės narius, motyvuoja mokytis užsienio kalbų. Ne kartą mokyklos dalyvavimas projektuose skelbtas ne tik miesto, bet ir respublikinėje bei kitų šalių spaudoje.